目次

• Beginning-１

  　主人公メグミが一騒動に巻き込まれ、バトルの腕前を披露

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• Beginning-２

  　特務工作部が投入され、動き出すロケット団

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• Beginning-３

  　VSロケット団。勝者と敗者。

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• Beginning-４

  　捕らえられたメグミ。しかし思いがけない流れに……？

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• Beginning-５

  　前進する気持ちと、裏で動き出す影

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• Beginning-６

  　擦れ違うポケモンへの想い。道具か、それとも……

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• Beginning-７

  　救出に向かうアキラの前に、再び立ち塞がる特務工作部

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• Beginning-８-

  　語られた本当の任務に涕泣するメグミを、更に巨大な影が襲う

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• Beginning-９

  　アキラVS特務工作部のダブルバトル

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• Beginning-10

  　ついに明かされる特務工作部の任務

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• Beginning-11

  　無事に解決したかのように見えた事件。しかし影は決して消えてはいなかった

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• Beginning-12

  　離別と共闘。とうとう訪れてしまった悪夢

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• Beginning-13

  　VSナナミのバンギラス

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• Beginning-14

  　月の下での細やかな攻防の末、新たな旅が始まる

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• 閑話：船は海原を駆ける

  　船旅の合間の休息

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• Encounter-１

  　巨大アフロの謎のダンスマン登場

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• Encounter-２

  　スナッチャー・レオとの出会い

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• Encounter-３

  　出会いは増える。敵も味方も。

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• Encounter-４

  　リュウト登場。VSシャドー戦闘員６兄弟

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• Encounter-５

  　アゲトビレッジでのリライブ

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• Encounter-６

  　バショウのスランプ

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• Encounter-７

  　アイオポート、フェナスシティでのバトル

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• Encounter-８

  　別行動したメグミとブソンに降りかかるアクシデント

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• Encounter-９

  　ダークポケモンが活動するゴロツキの町

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